1、毒蝇伞是鹅膏菌属的模式物种。
2、扩大范围来说，它也是鹅膏菌属的亚属，鹅膏菌亚属的模式物种，而在此亚属下面的鹅膏菌节，其模式物种也相同。
3、鹅膏菌属下面的鹅膏菌亚属，包含了所有无淀粉质孢子的鹅膏菌属物种。
【资料图】
4、鹅膏菌节包含了不均匀外菌膜遗迹的物种，也包含了缩小一系列同心环的菌托，和在蕈伞上成为一系列斑点或瘤的菌膜遗迹 。
5、鹅膏菌节由毒蝇伞和有密切关联的物种所组成，包含了豹斑鹅膏、芽状鹅膏、小托柄鹅膏和Amanita xanthocephala 。
6、现代真菌分类学家，基于大略的形态学和孢子的非淀粉质特性，把毒蝇伞和它们的近亲进行分类。
7、两个最近的分子系统发生学研究很自然地证实了上述的分类 。
8、毒蝇伞在形态学上变化很大，并且很多专家在毒蝇伞的范围内辨认出一定数目的亚种或变种。
9、在《The Agaricales in Modern Taxonomy》书中，德国真菌学家洛夫·辛格（Rolf Singer）列出3个亚种，虽然没有详尽的描述：A. muscaria ssp. muscaria、A. muscaria ssp. americana和A. muscaria ssp. flavivolvata 。
10、同时期的专家则辨认出多达7个的变种： 生长于斯堪地那维亚和阿拉斯加，肝棕色蕈伞，有黄色的瘤。
11、此变种也是有不同的认知，一些专家（杜罗斯）认为是独立的物种，其他专家（泽金斯）认为是毒蝇伞的一个变种2006年，由真菌学家乔瑟夫·泽尔（József Geml）团队，针对不同地区的毒蝇伞，进行一次分子系统发生学研究，发现这个物种可描绘出3个不同的支序；大致上可分为欧亚区域、欧亚的亚高山区域、和北美洲的族群。
12、所有3个支序的样本都可以在阿拉斯加找到；这导引出阿拉斯加为毒蝇伞的生物多样性中心点。
13、这份研究也观察4个已命名的变种：alba、flavivolvata、formosa（包含guessowii）和regalis。
14、所有4个变种在欧亚区和北美洲区支序里面都发现到，证明这些形态学上的构成只不过是多样性的表现，而不是不同的亚种或是变种 。
15、泽尔团队更进一步的分子研究在2008年出版，显示出3个基因群，外加在美国东南部松树、山胡桃木、松树组成的森林中，所发现到的第4个物种、和2个以上在加州圣克鲁兹岛的物种，在遗传学上很明显地被描述出每个基因群是分开的物种；因此毒蝇伞现今被认为是一个隐性的物种复合群 。
16、这个复合群也包含了至少3个其他有密切关联的分类，下面有3个有关联物种 ：Amanita breckonii，一个暗黄色蕈伞的蕈类，发现在西北太平洋上的针叶树林 ，和分别位于地中海区域和萨丁尼亚岛上，棕色蕈伞的A. gioiosa和A. heterochroma。
17、上述最后2个物种被发现在桉属和木犀属的树木上，而目前并不清楚到底是原生的还是从澳洲引进来的。
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